南京中医药大学是一所全国重点大学，位于江苏省南京市。该校成立于1954年，是中国中医药教育和科研的重要基地之一。关于南京中医药大学是否为一本或二本院校，其实需要分情况来看。

首先，就学历层次而言，南京中医药大学是一所综合性大学，拥有本科、硕士、博士等多个层次的教育。在本科层次上，南京中医药大学开设的主要有中医学、针灸推拿学、中药学、药学、生物医学工程、预防医学等专业，其中中医学、针灸推拿学、中药学是该校的优势专业。根据教育部的规定，本科教育分为本科一批、本科二批、本科三批以及高职高专等不同层次，其中本科一批和本科二批属于“一本”院校，而本科三批属于“二本”院校。南京中医药大学在本科教育方面，招收的学生主要来自本科二批和本科三批，因此，从这个角度来看，南京中医药大学可以被认为是“二本”院校。

其次，就综合实力而言，南京中医药大学是一所综合性大学，其学科设置较为齐全，教学质量和科研水平也均处于较高水平。南京中医药大学在全国综合性大学排名中，多次位列前列。此外，南京中医药大学的中医药学科在全国中医药学科排名中也位列前茅。因此，从这个角度来看，南京中医药大学可以被认为是“一本”院校。

综上所述，南京中医药大学是一所综合性大学，从学历层次来看，可以被认为是“二本”院校，但从综合实力来看，可以被认为是“一本”院校。无论如何，南京中医药大学都是一所具有较高学术水平和较好声誉的重点高校。